重庆个体营业执照丢失后注销，可按以下步骤进行：
登报声明：在市级公开发行的报纸上刊登营业执照遗失声明，说明营业执照遗失情况，声明原营业执照作废，需保留登报原件或凭证。也可选择在国家企业信用信息公示系统上进行营业执照遗失公示，若选择网上公示，则无需报纸报样。
准备注销材料：
填写完整的《个体工商户注销登记申请书》。
经营者身份证复印件，若经营者本人持身份证前来办理，则无需提供。
若有公章的还需带公章及备案登记卡。
委托他人办理的需出具委托书及被委托人身份证明材料。
营业执照正副本，若证件原件遗失，经营者可注明原因，并承诺承担由此产生的法律责任。
办理税务注销：到税务部门办理税务注销手续，结清应纳税款、滞纳金和罚款等，缴销发票、税务登记证件和其他税务证件，取得税务注销证明。如果是定额征收、没开过发票和税控盘的个体户，一般税务会同步完成注销。
办理工商注销：携带上述材料以及税务注销证明，前往当地工商行政管理部门（一般是辖区工商所或政务服务中心工商窗口）办理工商注销手续。工商部门会对提交的材料进行审核，审核通过后，即可完成个体营业执照的注销，并领取注销通知书

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