食品经营许可证的注销流程一般包括以下步骤：

一、提交注销申请
登录系统：申请人登录原发证的食品药品监督管理部门申报端，或省级食品经营许可管理系统。
填写申请书：在网上填写《食品经营许可注销申请书》，并附上相关申请材料。申请材料通常包括食品经营许可证的正本和副本，以及与注销食品经营许可有关的其他材料，例如企业终止经营的相关证明文件。
二、行政机关审核
提交资料：申请人向原发证的食品药品监督管理部门提交注销申请资料。
材料审核：行政机关收到申请后，对申请材料进行审核。审核过程中，行政机关会核实注销原因的真实性，并检查是否存在未结清的税费、罚款等事项。
作出决定：如果审核通过，行政机关将作出准予注销的决定；如果不符合条件，将依法作出不予注销的书面决定，并说明理由。同时，告知申请人享有依法申请行政复议或提起行政诉讼的权利。
三、公告与注销
公告：行政机关作出准予注销的决定后，会在官方网站或其他媒体上进行公告，告知公众该食品经营许可证已经注销。
系统注销：行政机关在其内部系统中完成注销操作，并将注销情况记录在案。
四、领取结果
申请人根据短信提示或网上个人中心查阅审批情况，到原发证的食品药品监督管理部门窗口领取《准予注销通知书》或不予注销决定书。
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