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在开封市水利设计资质办理过程中，如果发现专业技术人员系统备案显示重复，可能的原因和解决办法如下：

1. **信息录入错误**：
   - 可能是在录入系统时，同一人员的信息被多次输入，造成了重复记录。需要检查系统内是否存在相同的身份证号码或姓名等关键信息，如果存在，删除错误的重复记录，保留唯一正确的记录。

2. **历史遗留问题**：
   - 该技术人员可能曾经在其他单位做过备案，没有及时解除原有备案，导致再次备案时出现重复。这时需要联系原备案单位或者相关管理部门，办理注销或者转移手续。

3. **系统数据同步滞后**：
   - 如果该技术人员在系统内变更了信息（如转出转入、离职入职等），系统可能未能及时更新。这种情况需要与管理部门联系，确认信息更新状态，并协调解决。

4. **技术问题**：
   - 如果是系统技术问题导致的数据重复，应及时联系系统运维部门，报告问题，请求核实和修复。

解决步骤：
- 首先，详细检查和核对录入系统的人员信息，确保准确性。
- 联系开封市水利局或相关的资质管理部门，汇报问题，了解具体情况及解决办法。
- 如果是由于人员在其他单位已备案，需要收集相关证明材料，如解聘证明、新单位聘用合同等，配合管理部门进行信息变更或转移。
- 若是系统问题，按照管理部门的指导完成数据清理或修正。

总之，碰到此类问题，要及时与相关部门沟通，按照官方渠道解决问题，确保符合资质申报的规范要求。

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